Pod taktovkou Jiřího Bělohlávka provedl s Českou filharmonií Pendereckého Concerto Grosso pro tři violoncella spolu s kolegy Václavem Petrem a Ivanem Vokáčem. S dirigentem Tomášem Braunerem a SOČRem natočil Chačaturjanův Koncert e moll. Pod vedením Lukáše Vasilka s Pražským filharmonickým sborem provedl skladbu Johna Tavenera “Svjatyj”. Jako sólista vystoupil mj. s Filharmonií Bohuslava Martinů, Moravskou filharmonií Olomouc, Komorní filharmonií Pardubice ad. Vystoupil na recitálech v rámci festivalu Pražské jaro a Českého spolku pro komorní hudbu. Na Festivalu Jakuba Jana Ryby provedl Rybův Koncert C dur, který také v roce 2020 studiově nahrál pro vydavatelství Nibiru. V prosinci 2022 vystoupil v rámci českého předsednictví v Radě EU na koncertě v Auditorio Nacional de Música v Madridu v komorním programu s hudbou Antonína Dvořáka.

Eduard Šístek spolupracuje s pěveckým duem KCHUN (v současném složení Martin Prokeš & Jaromír Nosek), se kterým na festivalu Lípa Musica 2022 uvedl premiéru Stabat Mater od současného italského skladatele Marca Rosana ve verzi pro dva hlasy a violoncello, vytvořené autorem skladby přímo pro tento ansámbl. V květnu 2023 vznikla studiová nahrávka a na podzim téhož roku vyšla na CD. V říjnu 2023 toto dílo provedli v rámci festivalu Prague Music Performance, na kterém se k živému hudebnímu vystoupení připojili také tanečníci ze souboru DekkaDancers se svou choreografií. Následovala další provedení v rámci České republiky a v červnu 2024 vystoupili se stejným programem na festivalu Smetanova Litomyšl. Na jaře 2025 absolvovali společně turné po Německu.

V sezóně 2025/2026 vystoupí Eduard Šístek mj. v rámci Českého spolku pro komorní hudbu a provede Sonatu da camera Bohuslava Martinů s ansámblem L'Armonia Terrena pod taktovkou Zdeňka Klaudy.